良太开船去找男孩失踪的哥哥，遇到暴风雨漂流岛一座岛上，在那岛上发现了龙虾怪兽伊比拉，还有在岛上进行一项不为人知计划的神秘组织红竹，正巧碰到一位女原住民，通过她的帮助下四人潜入红竹的基地，竟发现哥斯拉在

地球联合宇宙局发现外太空有个X星球，因为X星球发射电波而发现，宇宙局派出太空船D1前去探查，太空人富士和古连到X星球时却备受礼遇，而X星球的人表示为了消灭在当地作乱的王者基多拉，需要借出哥吉拉和拉顿。